Lietuvos geologų sąjunga savo veiklą vykdo remdamasiLGS įstatais. Pagal juos, aukščiausią galią turi LGS suvažiavimas. Tarp suvažiavimų, bendra LGS veikla rūpinasi taryba ir valdyba. Savo specifines veiklas taip vykdo revizijos, etikos ir veiklos krypčių komisijos, LGS sekcijos ir skyriai.
